τη μικροβιολογία του δικτύου Δομημένου Περιβάλλοντος

6
τη μικροβιολογία του δικτύου Δομημένου Περιβάλλοντος
Σπίτι .Επιλεγμένα, Ποιότητα αέρα και αέρα, Coronavirus #COVID19 Journal Club: «Συλλογή του ιού SARS-CoV-2 από τον αέρα μιας κλινικής σε ένα Κέντρο Υγείας Φοιτητών του Πανεπιστημίου και αναλύσεις της γονιδιωματικής ακολουθίας του ιού»

https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Princess_Alexandra_Hospital_patient%27s_room.jpg

αυτό το άρθρο («Συλλογή του ιού SARS-CoV-2 από τον αέρα μιας κλινικής σε ένα Κέντρο Υγείας Φοιτητών του Πανεπιστημίου και Αναλύσεις της Ιικής Γονιδιωματικής Αλληλουχίας») τράβηξε την προσοχή μου αρχικά λόγω της πτυχής της δειγματοληψίας αέρα, αλλά διαβάζοντας την Περίληψη ήμουν χτυπημένος από κάτι άλλο. Εδώ έκαναν δειγματοληψία αέρα σε μια κλινική και είδαν ότι το δείγμα ήταν θετικό για SARS-CoV-2. Πολύ τυπικά πράγματα. Στη συνέχεια προχώρησαν στην καλλιέργεια για να αναζητήσουν ζωντανό ιό και βρήκαν θετικά αποτελέσματα καλλιέργειας στα κύτταρα Vero. Επίσης αρκετά στάνταρ. Στη συνέχεια όμως εξέτασαν τον ιό που στην πραγματικότητα σκότωνε τα κύτταρα του Vero… και δεν ήταν ο SARS-CoV-2. Στην πραγματικότητα ήταν τρεις άλλοι αναπνευστικοί ιοί. Αυτό με ανησυχεί αρκετά στο πλαίσιο της ύπαρξης ψευδώς θετικών αποτελεσμάτων καλλιέργειας. Πρέπει να επιβεβαιώσουμε ότι τα θετικά αποτελέσματα καλλιέργειας οφείλονται στην πραγματικότητα στον SARS-CoV-2; Περίληψη παρακάτω:

Η εξέλιξη του COVID-19 παγκοσμίως μπορεί να παρακολουθηθεί με τον εντοπισμό μεταλλάξεων εντός της γονιδιωματικής αλληλουχίας του SARS-CoV-2 που συμβαίνουν σε συνάρτηση με το χρόνο. Τέτοιες προσπάθειες βασίζονται επί του παρόντος στον προσδιορισμό της αλληλουχίας του γονιδιώματος του SARS-CoV-2 σε δείγματα ασθενών (άμεση αλληλούχιση) ή ιού που απομονώνεται από δείγματα ασθενών σε κυτταροκαλλιέργειες. Μια πιλοτική μελέτη δειγματοληψίας αέρα SARS-CoV-2 που διεξήχθη σε μια κλινική σε ένα πανεπιστημιακό κέντρο υγειονομικής περίθαλψης φοιτητών ανίχνευσε τον ιό vRNA, με εκτιμώμενη συγκέντρωση 0,87 γονιδιωμάτων ιού L–1 αέρας. Για να προσδιοριστεί εάν ο ιός που ανιχνεύθηκε ήταν βιώσιμος («ζωντανό»), έγιναν προσπάθειες απομόνωσης του ιού σε κυτταροκαλλιέργειες. Οι επαγόμενες από τον ιό κυτταροπαθητικές επιδράσεις (CPE) παρατηρήθηκαν εντός δύο ημερών μετά τον εμβολιασμό των κυττάρων Vero E6 με μέσα συλλογής από δείγματα αέρα. Ωστόσο, οι δοκιμές rtRT-PCR για SARS-CoV-2 vRNA από κυτταρική καλλιέργεια ήταν αρνητικές. Αντίθετα, τρεις άλλοι ταχέως αναπτυσσόμενοι ανθρώπινοι αναπνευστικοί ιοί απομονώθηκαν και στη συνέχεια ταυτοποιήθηκαν, απεικονίζοντας την πρόκληση απομόνωσης του SARS-CoV-2 όταν υπάρχουν πολλοί ιοί σε ένα δείγμα δοκιμής. Ωστόσο, η πλήρης γονιδιωματική αλληλουχία SAR-CoV-2 προσδιορίστηκε με την αλληλουχία Sanger και μοιάζει περισσότερο με τα γονιδιώματα του SARS-CoV-2 που περιγράφηκαν προηγουμένως στη Γεωργία των ΗΠΑ. Τα αποτελέσματα αυτής της μελέτης απεικονίζουν τη σκοπιμότητα παρακολούθησης της εξέλιξης της πανδημίας COVID-19 χρησιμοποιώντας περιβαλλοντικά δείγματα αερολύματος αντί για ανθρώπινα δείγματα. Η συλλογή ενός θετικού δείγματος από απόσταση μεγαλύτερη των 2 μέτρων από την πλησιέστερη κυκλοφορία ασθενών υποδηλώνει ότι ο ιός βρισκόταν σε αεροζόλ.

Schreibe einen Kommentar